黑麦草 （多年生黑麦草）是全球温带地区种植最广泛的牧草和休闲草种，需要了解关键农业性状和作物特性的遗传结构，以提供更广泛的环境服务。 哈珀 等. 旨在通过将基于细菌人工染色体 (BAC) 的物理图谱与全基因组关联研究 (GWAS) 相结合来识别与农业重要性状相关的基因组区域。
根据所使用的软件和概率阈值，派生了约 3600 到 7500 个物理图谱重叠群，并与约 35 个已测序的 BAC 克隆整合，以开发预计跨越大部分的资源 L.perenne 基因组。 从 GWAS 中，XNUMX 个不同的位点与抽穗期、株宽、植物生物量和水溶性碳水化合物积累显着相关，其中 XNUMX 个可能与物理图谱重叠群相关。 这允许识别许多候选基因。
将物理映射资源与 GWAS 相结合，使我们能够将对候选基因的搜索扩展到更大的区域 L.perenne 基因组，并确定了许多有趣的基因模型注释。 这些物理图将有助于验证未来基于序列的组装 L.perenne 基因组。
