Zingiberales 中的质体基因组和关系
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姜是哪里产的?

下一代测序用于为热带被子植物 Zingiberales 生成完整的质体基因集。

https://www.botany.one/plastid-genomes-relationships-zingiberales/

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Zingiberales 中的质体基因组和关系
Zingiberales 中的质体基因组和关系

姜目(Zingiberales)是热带被子植物的一个分支,包含八个热带单子叶植物科,约有2500个物种,据信它们在白垩纪时期经历了一次古老的快速辐射演化。姜目植物的花部形态差异显著,其中一些成员具有重要的生态和经济价值,例如生姜、豆蔻、姜黄、高良姜、香蕉和大蕉。以往的研究表明,姜目植物主要谱系之间的深层系统发育关系难以解析,这代表了单子叶植物生命之树中一个关键的不确定区域。姜目植物包含八个科,构成了一个多样化的分支,但其内部深层的系统发育关系仍知之甚少。

最近的一篇论文 Annals of Botany 使用下一代测序生成完整的质体基因组,发现质体基因组为许多关系提供了强有力的支持,但对包含Heliconiaceae order的支持却很弱。 各种数据矩阵属性的操作以不可预测的方式影响树形拓扑结构,这表明塑料体的完整编码区域不能提供足够的特征信息来解析这种快速、古老的辐射。

Barrett, CF、Specht, CD、Leebens-Mack, J.、Stevenson, DW、Zomlefer, WB 和 Davis, JI (2014) 解决古代辐射:完整的质体基因集能否阐明热带生姜(姜目)之间的深层关系? 。 Annals of Botany113(1),119 133。

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作者

AJ Cann

Alan Cann 是莱斯特大学生物科学学院的高级讲师,曾任 AoB 互联网咨询编辑。

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