以下是本周Bluesky上分享量最高的文章汇总。这周真是令人沮丧。倒不是因为找不到文章,恰恰相反。这里有很多文章我都想认真阅读并写下来。但也有很多同样精彩的文章没能入选。光周五一天就收到了足够多的文章,够我忙活一周了。不知为何,我之前一直以为夏天会比较清闲。和往常一样,需要付费阅读的文章都标有💰,否则在我查看时都是可以免费阅读的。
这是如何工作的
我们会扫描人们在社交媒体上发布的帖子。 博塔尼汽车 列出并提取包含论文链接的条目。每篇论文被撰写文章提及,即可获得 4 分;转发可获得 3 分;点赞可获得 1 分。
如果用户发布的内容中,植物学相关内容(不一定是论文链接)的占比达到 20% 或以上,我们会尝试将其添加到“植物学自动”版块。我们认为,由于整个列表的用户都对植物感兴趣,因此这类内容更容易脱颖而出。
如果您认为自己应该出现在 Botany Auto 名单上,但却不在,请留言至 @botany.one 在蓝天上。
1. 植物陆生化的起源:一次单一的基因创新
Mbadinga Zamar、DL 等人 bioRxiv · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 61 个赞 · 37 次转发
植物在450亿年前首次登陆陆地,其功能性创新是如何演化的,至今仍是一个谜。本文表明,一类酶的获得在其中两项创新演化过程中起着关键作用:一是保护植物免受脱水和紫外线伤害的角质层,二是促进水分和养分吸收的丛枝菌根共生。
梅兰妮·里奇 🌱🍄 @melaniekrich.bsky.social · 蓝天
最新预印本发布!
www.biorxiv.org/content/10.6...
对脂质、植物陆生化和植物共生起源的长期痴迷终于有了结果 1/7 🧵
@pierremarcdelaux.bsky.social @katharinamel1.bsky.social @tatiana-vernie.bsky.social @kellerjeanphd.bsky.social
2. 淡水沉水维管植物光合作用多样性研究的技术与挑战
Loew-Mendelson,E. 等人。 · 在植物科学中的应用 · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 29 个赞 · 16 次转发
水生植物的光合作用多样性可与陆生植物媲美,但支撑这种多样性的环境条件却截然不同。尽管存在这些环境差异,水生植物和陆生植物都趋同进化出了碳浓缩机制(CCMs)。然而,由于水生环境的方法学限制,对沉水植物中这些途径的研究落后于陆生植物。本文综述并评估了目前用于检测水生植物碳浓缩机制的方法。生理学方法,包括气体交换和同位素分析,能够为陆生植物的研究提供宝贵的信息,但在水生系统中却面临着诸多挑战。
卡罗琳娜·海杜克 @kheyduk.bsky.social · 蓝天
由@ellliieee.bsky.social 牵头,@wickellomics.bsky.social、其他实验室成员以及@li-corenv.bsky.social 的同事们协助完成的全新实验室论文——《我们如何研究水生植物的光合作用?》 事实证明,这相当困难! 论文既包含综述,也包含方法论部分。 快来看看吧! doi.org/10.1002/aps3...
蓝天视角 →3. 一种细菌代谢产物重塑真菌代谢,触发菌丝向酵母的转变。
Bharathwaj,M. et al. · 当代生物学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 40 个赞 · 13 次转发
真菌通过改变细胞形态来适应和定殖环境。对于白色念珠菌而言,其在人体内的共生定殖和毒力依赖于侵袭性菌丝和扩散性酵母细胞之间的可逆转换。酵母到菌丝的转换过程已被充分理解,但人们对菌丝反向转换回酵母的过程却知之甚少。我们开发了一种成像检测方法来可视化和量化菌丝到酵母的转换过程,结果表明细菌天然产物唐菖蒲素能够加速这一转换。
Ákos T Kovács @evolvedbiofilm.bsky.social · on Bluesky
一种细菌代谢产物重塑真菌代谢,触发菌丝向酵母的转变。
@currentbiology.bsky.social 由 Manasa Bharathwaj @mbharathwaj.bsky.social 等人提供,来自 Ana Traven
www.cell.com/current-biol...
4. 叶片盐雾排斥和组织耐受性是局部适应海洋盐雾的基础。
普伦克特,ML 等。 · 美国植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 33 个赞 · 11 次转发
对于沿海生态系统中的植物而言,抵御海洋盐雾的影响至关重要,然而,沿海植物对盐雾的适应机制尚不完全清楚。我们通过比较五对分别适应沿海和内陆生境的黄花猴面花种质资源,研究了其盐雾适应机制……我们的研究结果表明,植物对沿海生境的适应可能通常涉及多种机制的进化,以应对海洋盐雾带来的胁迫。
美国植物学会 @botsocamerica.bsky.social · on Bluesky
叶片盐雾排斥和组织耐受性是海洋盐雾局部适应的基础
@madisonplunkert.bsky.social、@pcdurant.bsky.social、@davidlowry.bsky.social 和 Katherine Egeler 的最新 #AJB 研究
doi.org/10.1002/ajb2...
#植物学 #植物科学 #猴面花 #沟酸浆
5. 形态发生调控因子 BABY BOOM 和 GRF-GIF 的组合可提高玉米转化效率并促进叶片再生。
陈,Z. et al. · New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 22 个赞 · 13 次转发
转化是植物遗传学和功能基因组学中不可或缺的工具。尽管玉米的稳定转化已不再是主要难题,但学术实验室仍然需要简便高效的转化方法。本文介绍了一种名为GGB的快速高效转化系统,该系统针对B104及其他玉米品系的未成熟胚转化进行了优化。该系统结合了两种不同的形态发生调控因子——小麦GRF4-GIF1嵌合体和玉米BABY BOOM (BBM)转录因子(因此得名“GGB”),并采用改良的QuickCorn转化方案,可在约2个月内再生出转化玉米幼苗,其转化效率比单独使用任一形态发生因子高7倍。
New Phytologist @newphyt.bsky.social · on Bluesky
形态发生调控因子BABY BOOM和GRF-GIF的组合提高了玉米转化效率并促进了叶片再生。
???? nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
Chen等人
@WileyPlantSci #植物科学
6. 通过多学科证据鉴定虎耳草属开花植物的食肉性
张XJ et al. · 自然通讯 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 25 个赞 · 9 次转发
从猎物到捕食者的转变是所有食肉植物共有的显著适应性创新,它们捕获并消化各种动物猎物以获取营养物质(氮,N)。本文报道了高山开花植物烛状虎耳草(Saxifraga candelabrum,虎耳草科;虎耳草目)的食肉习性。野外实验和植物标本馆调查表明,该植物通过腺毛主动吸引并捕获昆虫猎物。
李晨鑫 博士 @chenxinli2.bsky.social · on Bluesky
又发现了一种食虫植物,这次是在虎耳草属植物中。食虫性是植物界反复趋同进化而来的又一种生存策略。#植物科学
起步价 www.nature.com/articles/s41...
7. 在长期干旱实验条件下,热浪期间气孔解耦并不影响冬青栎(Quercus ilex)的叶片冷却或恢复。
Gauthey, A. 等人 · 树木生理学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 18 个赞 · 11 次转发
我们研究了地中海地区植物的叶片生理和冠层温度。 栎栎 这片森林经历了超过20年的实验性防雨处理,其中包括一次强烈的热浪(>40°C)。总体而言, 冬青 在极端高温下,植物表现出气孔解耦现象,但这种机制提供的蒸发冷却有限,并不能阻止冠层灼伤。长期干旱主要影响植物的恢复能力,而非气孔解耦本身的发生。
爱丽丝·戈西 @a-gthy.bsky.social · on Bluesky
🌳🌡️我们的新论文发表了!我们发现,在极端高温条件下,成熟的冬青栎树会发生气孔解耦;然而,这种机制对叶片降温的作用却微乎其微🍂
academic.oup.com/treephys/adv...
@charlottegrossiord.bsky.social
@mdekauwe.bsky.social
以及其他许多人
8. 重新思考土壤核心微生物组
李,J。 等。 New Phytologist · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 14 个赞 · 10 次转发
核心微生物组的概念源于宿主相关研究,用于描述在明确的空间、时间和生物学边界内保守的微生物成员或功能。然而,在土壤和植物相关微生物组研究中,该术语越来越多地被指为使用特定研究阈值或标准选择的分析定义的子集。通过综合近期文献和对生物能源作物田间土壤的跨地点分析,我们发现,核心微生物组的原始生物学含义已被数据集特定的分析标准所模糊。
New Phytologist @newphyt.bsky.social · on Bluesky
✨ 纸张聚焦 ✨
(🧵 1/6)重新思考土壤核心微生物组
nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
9. 通过工程改造大麦NLR的Exo70整合结构域,提高其抗稻瘟病能力。
Saado,I. 等。 植物细胞 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 10 次转发
细胞内免疫受体通过检测并响应病原体衍生的效应分子来保护植物免受微生物入侵,通常会触发细胞死亡反应。然而,病原体效应分子会进化以逃避免疫识别,从而导致威胁全球农业的毁灭性疾病。本文研究表明,大麦细胞内核苷酸结合富亮氨酸重复序列(NLR)RGH2 的整合 Exo70 结构域可以与稻瘟病病原效应分子 AVR-Pii 及其密切相关的小麦稻瘟病致病变体相互作用。
植物细胞 @theplantcell.bsky.social · on Bluesky
工程改造大麦NLR的Exo70整合域以提高抗稻瘟病能力(Indira Saado、Helen J Brabham、Josh W Bennett、Anson Ho Ching Lam、Inmaculada Hernández-Pinzón、Matthew J Moscou、Juan Carlos De la Concepcion、Mark J Banfield) doi.org/10.1093/plce... #植物科学 @aspbofficial
蓝天视角 →10. 整合单细胞组学技术以解析丛枝菌根共生的时空复杂性
Ferreras-Garrucho,G., 校长,T., 帕什科夫斯基,U. · 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 17 个赞 · 9 次转发
在本综述中,我们总结了丛枝菌根共生(AMS)时空控制的现有知识,评估了现有空间数据集与AMS研究的相关性,并为未来的研究提供了新的视角。
实验植物学杂志 @jxbotany.bsky.social · on Bluesky
🧬🌱 评论 🌱🧬
Ferreras-Garrucho 等人探索了单细胞技术的最新方法学进展,以揭示丛枝菌根共生的时空动态,重点关注细胞类型特异性的植物和真菌转录组。
🔗 doi.org/10.1093/jxb/...
#植物科学🧪
11. 三叠纪末期森林消失后,机会主义的侧生石松类植物在全球范围内大量繁殖
彭杰等 npj 古生态系统 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 21 个赞 · 7 次转发
陆地上的环境危机和大规模物种灭绝事件之后通常会伴随生态剧变,在此期间,机会主义植物会迅速在受损的土地上定居,形成短暂的“先锋”群落,这些群落先于复杂的森林生态系统的建立。本文在约201亿年前的三叠纪末期大规模物种灭绝事件之后,发现了类似的模式。我们记录了瑞典下侏罗统(赫塘阶)地层中侧生石松类植物的最后一次全球分布,并证明了母体植物斯科特石松(Lycostrobus scottii)与其大孢子和小孢子之间的生物学联系。
12. 洞察不可见之物:高光谱成像为根系经济学领域打开了一扇新窗口
雷瓦尔德,B. · New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 8 次转发
细根——植物的“隐秘部分”——调节水分和养分的吸收与运输,支撑着植物的资源利用策略,并影响着群落和生态系统的过程。然而,尽管根系具有重要的生态意义,但由于方法上的挑战,人们对根系的研究仍然远不及对叶和茎的研究。
13. 缬草基因组序列揭示了缬草烯酸生物合成和类黄酮代谢的候选基因
de Oliveira,JAVS, 巴埃斯,M., 普克,B. · bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 14 个赞 · 8 次转发
缬草(Valeriana officinalis)是一种以产生缬草烯酸而闻名的植物,缬草烯酸是一种具有抗焦虑特性的化合物。焦虑症是全球范围内严重的健康危机,影响着人们的日常生活。随着全球对天然、非合成抗焦虑药物的需求不断增长,缬草作为一种有前景但尚未充分利用的药用资源而备受关注。了解其基因组是揭示缬草烯酸生物合成基因的第一步,有助于进一步研究其生产过程。本文报道了缬草的首个基因组序列,组装大小为3.3 Gbp,N50为110.8 Mbp,并对其进行了注释,完整度达96.6%,为研究缬草特化代谢的遗传基础提供了基础资源。
14. 细菌小调控RNA ????
帕彭福特,K. · 自然评论微生物学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 21 个赞 · 5 次转发
在本综述中,我总结了细菌 sRNA 的调控功能,描述了控制其表达和调控后果的分子机制,并讨论了围绕细菌中 sRNA 介导的基因调控的许多令人兴奋的未解之谜。
15. 群体基因组学告诉我们关于选择和植物适应的动态有哪些信息?
高特,理学学士 等。 分子生物学与进化 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 10 个赞 · 8 次转发
群体基因组学彻底改变了我们对自然选择如何塑造植物基因组的理解。全基因组重测序数据的爆炸式增长使得我们能够估算基因组的核苷酸多样性,阐明选择如何与重组和种群动态相互作用,并将推断范围从作物和模式物种扩展到几乎所有植物系统。本文总结了自然选择作用于植物基因组的关键经验和尚未解决的挑战。
16. 部分菌根异养:丛枝菌根植物的常见策略?
默克公司,VSFT 等。 New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 9 个赞 · 8 次转发
绝大多数陆生植物会将光合作用产生的有机碳的一部分转移给根细胞内的丛枝菌根(AM)真菌;反过来,这些真菌又帮助植物从土壤中吸收养分和水分。少数不进行光合作用的“腐生异养”植物也能从菌根真菌中获取这些碳,它们同样利用了相同的真菌网络。然而,最近的研究表明,某些绿色植物也可能从AM真菌中吸收碳。如果属实,那么它们就应该被归类为部分腐生异养生物(混合营养生物),而非纯粹的自养生物。本文将探讨支持这一性状存在和普遍性的进化、生态生理、形态、遗传和环境证据。
17. 植物生物声学:解码超声波发射 ????
Font Bordera, P. 等人 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 14 个赞 · 6 次转发
几十年来,人们一直认为植物与环境的相互作用主要由化学和视觉刺激介导。然而,最近的研究揭示了植物生理学中一个鲜为人知的维度:空气传播的超声波辐射。本文综述了植物生物声学领域的最新研究进展,重点关注超声波的产生、特征以及在不同胁迫条件下的特异性。
18. 非本地植物的菌根策略因生物群落和干扰程度而异。
新加坡卡扎尼加 等。 自然生态与进化 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 9 个赞 · 7 次转发
预测哪些非本地植物物种能够成功定植以及定植地点对于生物多样性的保护和管理至关重要。理论表明,非本地植物的菌根策略可能预示着它们定植的成功率。本文结合了包含440,788个植被样方的全球数据集以及植物本地状态和菌根类型的数据,以评估非本地植物的菌根策略。
19. 结合物种关联性和环境响应来指导指示物种的选择
Rissanen,T. 等。 生态应用 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 14 个赞 · 5 次转发
生物多样性正以前所未有的速度变化,凸显了有效且可扩展的生态监测的必要性。然而,选择监测哪些物种仍然是一项重大挑战。指示物种可以经济有效地反映更广泛的生物多样性趋势,但在气候、土地管理及其相互作用塑造的复杂且快速变化的生态系统中,缺乏稳健的、数据驱动的方法来识别指示物种,这方面存在着关键的空白。我们提供了一种基于模型的方法来选择潜在的指示物种,用于监测北方森林的林下植被群落。林下植被群落是森林生物多样性的重要组成部分,但通常不像树木那样得到持续监测。我们重点关注维管植物,因为它们与多种生物类群存在关联。我们利用联合物种分布模型,研究了芬兰全国范围内物种间和物种与环境之间的关系。我们采用了覆盖近3000个研究地点、不同土壤类型和生物气候带的林下植被数据,以及代表气候、生境和森林管理的关键环境因子。
封面图片: 大叶大叶藻 by 劳埃德·埃斯勒 / iNaturalist CC BY-NC