以下是本周的汇总。有时，找到与文章相配的图片可能很困难。例如，我想搜索草原的图片，但很多草原照片都聚焦于隐藏在草丛中的捕食者。然而，搜索…… 雄龙属 这张照片展现了极光勾勒出的剪影。和往常一样，需要付费阅读的文章会标有💰，否则在检查时可以免费阅读。
这是如何工作的
我们会扫描人们在社交媒体上发布的帖子。 博塔尼汽车 列出并提取包含论文链接的条目。每篇论文被撰写文章提及，即可获得 4 分；转发可获得 3 分；点赞可获得 1 分。
如果用户发布的内容中，植物学相关内容（不一定是论文链接）的占比达到 20% 或以上，我们会尝试将其添加到“植物学自动”版块。我们认为，由于整个列表的用户都对植物感兴趣，因此这类内容更容易脱颖而出。
如果您认为自己应该出现在 Botany Auto 名单上，但却不在，请留言至 @botany.one 在蓝天上。
1. 草原破坏会导致植物性状发生变化，这种变化在恢复期仍然存在。 ????
内尔勒卡尔，AN 等。 诉讼中的国家科学院院士 · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 53 个赞 · 27 次转发
我们综合分析了来自六大洲24项研究中742种植物的性状数据，以了解原始草地和次生草地指示植物物种在性状上的差异。与原始草地相比，次生草地指示植物株高更高，叶片氮含量更高，比叶面积更大，干物质含量更低。
拉尔斯·布鲁德维格 @lars-brudvig.bsky.social · 蓝天
来自 @ashishnerlekar.bsky.social、@llseedsull.bsky.social 和我以及其他许多人的最新发现：草原破坏会导致植物性状发生变化，而这种变化会在恢复期持续存在。
www.pnas.org/doi/10.1073/...
eeb.msu.edu/news/why-anc...
2. TOR-NOT4信号通路将植物的翻译与共翻译质量控制联系起来
施瓦茨，马萨诸塞州 等。 自然通讯 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 42 个赞 · 21 次转发
蛋白质合成必须与质量控制紧密协调以防止蛋白毒性应激，然而，植物中共翻译监控的机制及其与翻译输出的协调方式仍知之甚少。本文在拟南芥中鉴定出三个NOT4样E3泛素连接酶，它们是共翻译蛋白质质量控制的调控因子，并揭示了NOT4与雷帕霉素靶蛋白（TOR）信号通路之间的功能联系，该联系协调了质量控制能力与翻译输出。
丹·吉布斯 🌱🧬 @djgibbs.bsky.social · on Bluesky
蛋白质合成会根据环境动态变化，但细胞如何确保其蛋白质质量控制机制能够适当地适应不断变化的翻译需求呢？
我们在发表于@natcomms.nature.com 的新研究中探讨了这个问题。 www.nature.com/articles/s41...
3. 森林生态系统中的草本植物：一百个基础和应用问题
拉达莫尼，HVN 等。 植被学报 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 22 个赞 · 13 次转发
鉴于目前对森林草本植物的研究存在知识空白，并认识到拓展和精简森林草本植物研究范围至关重要，我们着手确定100个与这一独特植物类群生态学相关的基础性和应用性问题。首先，我们开展了一项在线调查，并在生态学界广泛分享，共收集到130个问题。随后，我们举办了一场为期三天的研讨会，邀请了在不同森林生态系统领域具有专长的草本植物研究人员参加。在研讨会上，经过多轮讨论、修改和措辞调整，最终确定了这些问题。
马丁·多夫恰克🌳🌱🌻 @dovciak-lab.bsky.social · 在 Bluesky
🌿 新论文！森林草本层可占植物多样性的80%，但仍未得到充分研究。
我很高兴能为耶鲁大学牵头的这项合作做出贡献，该合作提出了 100 个问题，以推进森林草本层生态学的发展。
我们错过了什么？
🔗 onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10....
蓝天视角 →4. 基于转录因子注释预测植物有机体复杂性：一种人工智能方法
Varshney，D. 等。 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 16 个赞 · 11 次转发
形态复杂性的演化机制仍然是个谜。虽然在藻类、植物和动物中都有证据表明，转录因子（TF）库的多样化是生物体复杂性演化的原因，但也有许多谱系遵循着各自独特的复杂性演化路径，例如通过特定家族的扩张……在此，我们将先前已有的细胞类型数量数据集从12个蛋白质组扩展到82个，并引入了一个四类体型结构方案。
斯特凡·A·伦辛 @rensingstefan.bsky.social · 蓝天
基于预训练Transformer架构的TabPFN能否根据植物的转录因子组成预测其生物体复杂性？答案是肯定的： www.biorxiv.org/content/10.6...
很高兴听到你的想法！
@dvarshney.bsky.social @jandevries.bsky.social @watertoland.bsky.social
5. 更快、更大、更严重：极端野火蔓延为北美西部和北方森林生态系统的变化埋下伏笔
库珀，JD 等。 科学进展 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 25 个赞 · 7 次转发
少数快速蔓延的野火事件会烧毁不成比例的大片区域。但除了过火面积之外，快速蔓延的火灾是否还会产生独特的火灾后生态影响？本文测量了2012年至2023年间发生在加拿大和美国西部针叶林中的3499起火灾的每日线性火灾增长率，并评估了火灾蔓延、燃烧严重程度以及火灾后景观恢复力指标之间的关系。
Bluesky 上讨论过 @grumpyunclesean.bsky.social.
6. 灰霉病病毒X ORF2以触发限制的方式抑制RNA沉默，并且与Dicer样基因表达的改变有关。 灰葡萄孢（Botrytis cinerea）
拉拉尼，F. 等。 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 9 次转发
RNA干扰（RNAi）是真菌中一种重要的抗病毒防御机制，然而，功能明确的真菌病毒RNA沉默抑制因子（VSR）相对较少，尤其是在植物病原宿主中。灰霉病病毒X（BVX）是α-屈曲病毒科的一种正链RNA病毒，可感染灰葡萄孢菌（Botrytis cinerea），并编码五个预测的开放阅读框（ORF），其中大多数功能未知。本研究利用互补的基于GFP的检测方法，在烟草（Nicotiana benthamiana）中筛选了BVX ORF 2-5的RNA沉默抑制活性，并检测了其中活性最高的候选基因在真菌宿主灰葡萄孢菌中的活性。
彼得·莫菲特 @moffettpeter.bsky.social · on Bluesky
实验室最新预印本中，我们鉴定出一种来自真菌病毒的 RNA 沉默抑制因子，该因子在植物体内也发挥作用。
www.biorxiv.org/content/10.6...
7. Palette——一种用于可视化兰花中目标基因表达水平的系统 ????
杨志强 等。 植物生理学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 9 次转发
这项研究通过混合两种植物色素，就像艺术家在调色板上混合颜料一样，利用多种基因转化方法创造出新的花色，为追踪兰花中的基因表达提供了一个可视化的系统。
植物生理学 @plantphys.bsky.social · on Bluesky
Palette——兰花目标基因表达水平可视化系统（Zhenyu Yang，Su Ni，Qiyu Zhang，et al） doi.org/10.1093/plph... #植物科学 @aspbofficial
蓝天视角 →8. 氮对外生菌根真菌的影响：从资源交换到森林碳循环
考克斯，F. · 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 11 个赞 · 8 次转发
无机氮(N)已知会影响外生菌根(ECM)真菌群落的组成和功能。研究一致表明，与碳(C)利用相关的真菌特性是决定真菌对高浓度无机氮敏感性的关键因素，对碳需求量更高的ECM真菌数量会沿着无机氮梯度下降。这种下降通常归因于寄主树木向其真菌共生体分配的碳减少，但尽管进行了大量研究，其背后的确切机制仍不清楚。本文探讨了该领域的最新进展，重点阐述了真菌营养需求和源-汇动态在调节ECM真菌碳流中的作用。
实验植物学杂志 @jxbotany.bsky.social · on Bluesky
🌲专家观点🌲
本文探讨了植物与外生菌根之间的资源交换如何驱动外生菌根真菌群落对氮有效性的响应，以及这种响应对森林碳循环的影响——菲利帕·考克斯
🔗 doi.org/10.1093/jxb/...
#植物科学🧪
蓝天视角 →9. 细菌内共生体通过破坏抑制疾病的根际微生物群落来增强真菌的毒力。 ????
周，X. et al. · 细胞宿主与微生物 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 13 个赞 · 7 次转发
细菌内共生体（生活在真菌细胞内的细菌）增强真菌病原体适应性和毒力的机制仍不甚明了。本文报道了番茄枯萎病菌（Fusarium wilt）的这种机制。 尖孢镰刀菌 F。 sp。 番茄 （FOL）主持人 无色杆菌 spp. 能增强真菌毒力的内共生菌。
Ákos T Kovács @evolvedbiofilm.bsky.social · on Bluesky
细菌内共生体通过破坏抑制疾病的根际微生物群落来增强真菌的毒力。
来自南京农业大学钟伟的@cp-cellhostmicrobe.bsky.social
与 @fdiniandreote.bsky.social 和 Alex Jousset 一起
www.sciencedirect.com/science/arti...
10. 植物细胞外水诱导的非典型免疫
Gaudreault-Lafleur，F. 等人。 · bioRxiv · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 14 个赞 · 5 次转发
许多微生物病原体致病的关键可观察毒力机制是诱导宿主细胞外空间（即质外体）形成富含水分的微环境，即水渍状病斑。鉴于这种毒力机制的普遍性，我们探究植物是否会响应病原体诱导的细胞外水分而激活免疫程序。
11. 绿色植物谱系及其他植物的耐旱机制
舒斯特，J., 范布伦，R. · New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 6 次转发
在此，我们综合了我们目前对植物耐旱性的进化起源和核心机制的理解，并将其置于跨界的更广泛的比较背景下。
12. 一克土壤中蕴藏着无数生命：将生命周期生物学与土壤生态学联系起来
范·格斯特尔，J. · ISME杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 14 个赞 · 6 次转发
本文探讨了土壤中微生物的生命周期。我从校园里采集的一克土壤样本入手，探究生命周期生物学的基本概念，分析生命周期如何在环境中产生，以及物种间的生命周期是如何相互关联的。
13. 植物免疫条件下细菌病原体的转录组图谱 ????
Nobori, T. 等人 诉讼中的国家科学院院士 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 20 个赞 · 4 次转发
本研究建立了两种利用RNA测序进行植物体内细菌转录组分析的方法。通过分析27种植物免疫突变体和丁香假单胞菌菌株的组合，我们成功鉴定了受植物免疫激活影响的特定细菌转录组特征。
14. 代谢建模通过简化天然微生物群落来促进合成群落的设计 ????
林，X. 等。 环境微生物学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 13 个赞 · 6 次转发
天然微生物群落通常组成复杂，代谢相互作用也尚不明确，这限制了它们的应用。传统的实验方法难以阐明微生物群落内部这些错综复杂的相互作用。本文提出了一种基于模拟的方法，通过代谢建模简化复杂的微生物群落，从而设计合成群落（SynComs）。
15. 从水生到陆生：光合生物tRNA基因库的演化
胡默尔，G. 等。 EMBO杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 9 个赞 · 7 次转发
光合真核生物经历了从水生到陆生栖息地的进化转变，伴随着基因组结构和基因调控的改变。然而，尽管转移RNA（tRNA）基因库在翻译过程中发挥着核心作用，但对其进化的研究却相对较少。本文综述了tRNA基因的组成、结构和基因组组织在光合生物谱系（主要是古植物界）中的多样化过程，以及这些变化与进化转变之间的关系。
16. 重新定义病原相关蛋白：从植物免疫驱动因子到胁迫适应性整合节点
穆德赫尔·阿布-阿尔特门，W. 卡斯特罗韦德，CDM · 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 11 个赞 · 6 次转发
传统上，病程相关蛋白（PR蛋白）被视为抵御病原体感染的防御蛋白，它们包含19个不同的家族，涵盖防御相关酶（葡聚糖酶、几丁质酶、核酸酶、蛋白酶）、抗菌肽、酶抑制剂和活性氧（ROS）生成蛋白。尽管它们在生物胁迫中的重要性已得到充分证实，但关于它们在非生物胁迫（例如盐胁迫、干旱、重金属暴露、温度和洪涝）中的动态调控和功能作用的研究也开始涌现。通过综合近期研究成果和关键知识空白，我们提出PR蛋白是植物全球胁迫整合节点，连接着植物对非生物和生物胁迫的响应。
17. 铁依赖性的损伤相关肽受体信号重编程协调免疫和磷酸盐应激适应
土田，N.等人。 · bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 11 个赞 · 6 次转发
植物对无机磷酸盐（Pi）限制的适应涉及广泛的发育和代谢重编程，统称为磷酸盐饥饿反应（PSR）。植物如何平衡营养获取和免疫能力仍未得到解决。本文研究表明，PSR选择性地重塑了拟南芥中的模式识别受体（PRR）信号通路。
18. 淡水沉水维管植物光合作用多样性研究的技术与挑战
Loew-Mendelson，E. 等人。 · 在植物科学中的应用 · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 8 个赞 · 5 次转发
水生植物的光合作用多样性可与陆生植物媲美，但支撑这种多样性的环境条件却截然不同。尽管存在这些环境差异，水生植物和陆生植物都趋同进化出了碳浓缩机制（CCMs）。然而，由于水生环境的方法学限制，对沉水植物中这些途径的研究落后于陆生系统。本文综述并评价了目前用于检测水生植物中碳浓缩机制的方法。
19. 珍珠粟和指粟的简易种子穿刺转化方案
莫因，M., 蒂亚吉，W.，Sreevarshitha，G.· AoB PLANTS · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 11 个赞 · 5 次转发
珍珠粟和指粟由于其本身对基因转化方法的耐受性较差，在采用转基因或基因编辑方法方面面临诸多挑战。为了克服这些限制，本研究旨在简化珍珠粟和指粟的基因转化流程。
20. STRUBBELIG–NHL3 细胞表面受体复合物介导拟南芥对纤维素缺乏的反应
博伊金，R. 等。 Nature Plants · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 8 个赞 · 6 次转发
细胞壁完整性因纤维素生物合成抑制而遭到破坏后，细胞壁重塑依赖于受体激酶STRUBBELIG (SUB)及其结合伴侣QUIRKY (QKY)。本文鉴定出非种族特异性抗病/HIN1发夹诱导样蛋白3 (NHL3)是参与SUB依赖性纤维素生物合成抑制反应的另一个因子。
封面图片： 须芒草 by -Rorey- / iNaturalist CC BY
