以下是本周您在 Bluesky 上分享的热门文章汇总。需要付费阅读的文章会标有💰,否则在检查时均可免费访问。
本周我修改了系统的数据采集器工作方式。目的是为了减小邮件的文件大小,因为之前的文件有点大了。我还添加了更多关于论文评分方式的详细信息,这样你就可以看到某篇文章获得了多少点赞或转发。
这是如何工作的
我们会扫描人们在社交媒体上发布的帖子。 博塔尼汽车 列出并提取包含论文链接的条目。每篇论文被撰写文章提及,即可获得 4 分;转发可获得 3 分;点赞可获得 1 分。
如果用户发布的内容中,植物学相关内容(不一定是论文链接)的占比达到 20% 或以上,我们会尝试将其添加到“植物学自动”版块。我们认为,由于整个列表的用户都对植物感兴趣,因此这类内容更容易脱颖而出。
如果您认为自己应该出现在 Botany Auto 名单上,但却不在,请留言至 @botany.one 在蓝天上。
1. OpenEvo:一个用于自动化进化和分析的开源平台
科乔巴,SS 等。 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 105 个赞 · 33 次转发
本文介绍 OpenEvo,一个完全开源、低成本的浊度恒温器平台,用于自动化连续培养和定向进化实验。现有工具要么价格昂贵、结构复杂,要么缺乏开源硬件;OpenEvo 弥补了这一空白,提供了一个完整的、全自动的进化平台,包含详细的图文并茂的搭建说明(适合初学者)、开源软件和固件,售价约为 300 美元。
塞巴斯蒂安·S·科乔巴 @atinygreencell.bsky.social · on Bluesky
我和 @breakliquid.bsky.social 非常高兴地宣布,我们的 OpenEVO 预印本终于上线啦!这是一款开源的手工混浊度仪,模块化、价格亲民,而且可以定制。我们倾注心血,为科研社区打造了这款产品。敬请欣赏!💚
www.biorxiv.org/content/10.6...
2. 区分极端气候条件下的叶片灼伤和衰老 ????
贝格斯特伦,M. 等。 自然气候变化 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 53 个赞 · 25 次转发
近几十年来,全球气温迅速上升,导致干旱、热浪及其伴随发生的极端事件(即所谓的“高温干旱”)更加频繁。这些事件造成温带森林叶片大范围且突然变色,例如2021年太平洋西北地区热穹顶以及2018年和2022年欧洲大范围高温干旱期间所观察到的情况。由于叶片变色通常与秋季衰老相关,因此这种变色常被解释为过早衰老或胁迫诱导的衰老。然而,并非所有早期变色都反映了衰老程序的启动:高温干旱下的热损伤和水分流失也会导致叶片被动灼伤。
夏洛特·格罗西奥德 @charlottegrossiord.bsky.social · on Bluesky
很高兴与大家分享我们关于叶片灼伤的新论文。🔥高温干旱期间叶片早期褐变通常被误解为叶片过早衰老,但它也可能反映的是快速的热损伤。区分这些过程至关重要。 www.nature.com/articles/s41...
@wslresearch.bsky.social
3. 地衣真菌黄衣藻(Xanthoria parietina)产生的铁载体为其藻类共生体提供支持。
哈帕赫,I. 等。 自然通讯 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 45 个赞 · 20 次转发
在此,我们对与微藻光合生物 Trebouxia decolorans 相关的全球分布的地衣形成真菌 Xanthoria parietina 的铁获取系统进行了表征。
尼克·塔尔博特 @talbotlabtsl.bsky.social · on Bluesky
地衣 Xanthoria parietina 的真菌共生体产生铁载体铁铬素,使其能够获取铁并与藻类光合共生体进行营养交换。感谢我的团队以及 Hubertus Haas 领导的 @metalichen.bsky.social 的出色合作👇
www.nature.com/articles/s41...
4. 一项复活实验揭示了一种常见农田杂草的适应潜力降低
主教,SGD, 斯廷奇科姆,JR, 鲍科姆,RS · 进化信件 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 32 个赞 · 11 次转发
在人为全球变化加速的背景下,适应性进化对于种群响应至关重要。尽管理论和一些实证研究表明,当代环境变化的速度可以通过同样快速的进化转变来应对,但自然系统中预期进化与实际进化之间的不匹配仍然普遍存在。我们采用复活方法,证明牵牛花(Ipomoea purpurea)中授粉和交配系统性状之间的遗传协方差结构正日益限制着其进化轨迹。
Bluesky 上讨论过 @gbaucom.bsky.social.
5. RBMP2 可形成用于在蛋白核冷凝物中输送 CO₂ 的特殊膜。
吴,H. 等。 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 29 个赞 · 8 次转发
全球约三分之一的二氧化碳固定发生在藻类的蛋白核中,蛋白核是二氧化碳固定酶Rubisco的凝聚体,其内部有膜结构,为蛋白核提供二氧化碳。在模式藻类莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)中,二氧化碳由这些膜结构中一个特殊的中央网状区域输送。本文阐明了该区域的构建方式,并确定RBMP2是其生物合成所需的第一个因子。
马丁·乔尼卡斯 @mjonikas.bsky.social · on Bluesky
藻类蛋白核极大地促进了全球二氧化碳的固定。其功能的核心在于输送二氧化碳的特殊膜结构。我们发现,RBMP2 蛋白负责制造这些膜结构——并且发现这些神秘的微管似乎能够增强二氧化碳的输送!
www.biorxiv.org/content/10.6...
6. 凤梨科植物蜂鸟授粉的起源和多样化
前进,EA, 汤普森,JB · 林奈学会植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 23 个赞 · 9 次转发
本文构建了一个全新的凤梨科植物传粉媒介数据库,涵盖了所有亚科中70%的属,共包含403种凤梨科植物,并在系统发育框架下对这些数据进行了分析。我们估算了祖先状态,结果表明传粉媒介具有广泛的易变性,包括许多此前未知的转变。其中许多转变发生在近期进化过程中,表明传粉媒介的更替仍在持续。尽管背景多样化速率存在显著的异质性,但蜂鸟传粉被证实是物种多样化的重要驱动因素,我们证明,即使在对未采样物种中蜂鸟传粉普遍存在的不切实际的假设下,这一结果也不太可能改变。
杰米汤普森 @jamiet-42.bsky.social · on Bluesky
林奈学会植物学杂志 (Botanical Journal of the Linnean Society) 现已发表新论文 @botjlinnsoc.bsky.social 🌼
由学生领导,伊丽莎白·福沃德!
蜂鸟使凤梨科植物(菠萝科)的物种多样化速度几乎翻了一番。
@leverhulme.ac.uk @uor-research.bsky.social
doi.org/10.1093/botl...
7. 通过计算设计从头整合的结构域,可以合理控制植物 NLR 免疫受体中病原效应物的识别。
奚,Y. 等。 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 13 个赞 · 11 次转发
在此,我们描述了一个可编程框架,该框架利用生成式 AI 蛋白质设计工具 RFdiffusion 和 ProteinMPNN,设计针对各种病原体效应物的全新整合结构域 (ID)。
bioRxiv 植物生物学 @biorxiv-plants.bsky.social · on Bluesky
通过计算设计从头整合的结构域,可以合理控制植物 NLR 免疫受体中病原效应物的识别。 https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737686v1
蓝天视角 →8. 热带森林正面临着越来越大的暴露于临界温度阈值的风险。 ????
范蒂尔,N. 等。 诉讼中的国家科学院院士 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 21 个赞 · 8 次转发
在热浪日益频繁且强度不断增加的今天,了解热带树种距离可能阻碍光合作用的临界温度阈值有多近至关重要。我们利用遥感地表温度和树种分布图,研究了2001年至2020年间南美洲、东南亚和中非208种热带树种的热安全裕度(TSM,即临界光合温度T<sub>crit</sub>与最高冠层温度之差)的时空变化。
夏洛特·格罗西奥德 @charlottegrossiord.bsky.social · on Bluesky
🌳热带森林的光合作用极限究竟有多近?我们的新论文强调了这些生态系统对进一步变暖的脆弱性,以及准确表征林冠温度的重要性。 www.pnas.org/doi/10.1073/... @wslresearch.bsky.social
9. 提高人工林景观的结构异质性可以促进林下植物群落的γ多样性,但不会促进β多样性。
布拉德勒,PM 等。 Journal of Applied Ecology · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 18 个赞 · 8 次转发
尽管生境异质性已被证实能够提升局部物种多样性,但管理措施驱动的结构异质性对林下植物群落空间尺度的影响仍知之甚少,而林下植物群落对森林生物多样性和生态系统功能至关重要。为了分析林下植物群落如何响应人工林中结构异质性的增强,我们建立了11个实验样地,每个样地包含两组配对的森林景观:一组为未经处理的同质对照区,另一组为处理区(ESBC,即结构β复杂性增强区)。在处理区中,我们通过对光照和枯木特征进行不同组合的局部斑块尺度调控来增强结构异质性,从而在景观尺度上提高了斑块间的异质性。
皮娅·布拉德勒 @piambr.bsky.social · on Bluesky
我们关于林下植被如何响应增强的森林结构的论文刚刚发表在 @jappliedecology.bsky.social!
我们发现,景观尺度上光照条件的异质性驱动了α多样性和γ多样性的增加🌱🌳🥬
besjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
10. EPOS1是蛋白核淀粉鞘正常形成和CO₂效率所必需的。2-浓缩机制 莱茵衣藻 ????
阿德勒,L. 等。 New Phytologist · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 7 个赞 · 8 次转发
基于蛋白核的二氧化碳浓缩机制(pCCMs)通过向核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶输送更高浓度的二氧化碳来促进光合作用。蛋白核通常被淀粉鞘包裹,淀粉鞘被认为可以提高pCCM的效率,但人们对淀粉鞘的形成机制知之甚少。本文研究了莱茵衣藻中蛋白核相关蛋白EPOS1在淀粉鞘形成中的作用。
New Phytologist @newphyt.bsky.social · on Bluesky
EPOS1是衣藻中蛋白核淀粉鞘正常组装和CO2固定所必需的。
Liat Adler 等人
nph.onlinelibrary.wiley.com/share/UGKQVT...
#植物科学
11. 揭示角质层形成机制:植物光敏色素B及其下游信号通路调控番茄果实角质层沉积 ????
Fernandes, LLG 等。 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 11 个赞 · 8 次转发
角质层是一种疏水屏障,可限制水分流失和病原体入侵。尽管光照会影响角质层的形成,但其潜在机制仍知之甚少,尤其是在果实中。本文研究表明,在富含远红光的光照条件下生长的番茄果实,其角质层厚度增加,角质素和蜡质生物合成基因表达上调。
12. 应对高温:热带植物群落耐热性的长期动态和可塑性 ????
Hernández,GG 等。 New Phytologist · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 8 个赞 · 7 次转发
全球气温升高给植物带来了巨大的挑战,尤其是对适应热稳定环境的热带物种而言。因此,我们利用长达 7 年的调查数据,研究了哥斯达黎加加勒比海低地热带雨林中 35 种姜目植物群落的光合作用耐热性的长期动态变化。
13. 邻近植物通过重塑根系微生物群落来改变植物-土壤反馈模式。 ????
库尔班,M., 戈麦斯,SIF, Bezemer,™ · Nature Plants · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 6 次转发
土壤微生物群落和邻近植物均对植物生长产生显著影响,从而塑造群落动态。尽管这些过程已被广泛研究,但很少有研究将它们整合到一个机制框架中。因此,它们之间的相互作用机制仍然知之甚少。本文采用植物-土壤反馈方法,研究了六种草地植物在无菌土壤以及含有同种和异种植物遗留土壤中单独生长或与五种不同邻近植物共同生长的情况,以探讨这些问题。
14. 植物再生:通过重编程气孔前体细胞打破全能性的沉默 ????
Torii,KU 当代生物学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 10 个赞 · 7 次转发
植物具有将体细胞重编程为干细胞的非凡能力。一项新研究表明,转录因子LEC2与SPEECHLESS共同作用,可直接将气孔前体细胞重编程为全能性体细胞胚胎始祖细胞。
15. 陆生植物配子囊的模式形成与演化
Sorojsrisom等人 国际植物科学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 16 个赞 · 5 次转发
配子囊是陆生植物配子体的重要器官,负责形成、容纳和散播配子。由于其重要的生物学意义,配子囊的结构在谱系内往往高度保守,但主要谱系之间仍存在显著的形态差异。陆生植物配子囊的形态和发育已被研究超过150年,但关于其进化起源、同源性以及基因组如何调控其形态模式等重要问题仍然存在。
16. 隐花色素介导的信号传导在根系发育中的作用
佩雷斯·托雷斯,M., 佩德梅尔,紫外线 · New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 12 个赞 · 5 次转发
隐花色素(CRYs)通过长距离信号传导和根组织局部活性,在不同的环境条件下影响生长素介导的根生长、长距离蔗糖信号传导和细胞分裂。本文综述了CRY介导的系统性和根自主性通路、环境调控、跨物种保守性,并探讨了CRY调控根生长中尚未解决的问题。我们提出的问题是:(1)姜目植物群落的耐热性是否随年份变化?如果存在,这种年际变化是否与环境温度的变化相关?(2)不同物种的年际可塑性是否存在差异?这种差异是否会影响它们多年来的相对耐热性排名?
17. 基因组编辑精确增强耐盐性 粳稻 水稻产量
周明 等。 植物综合生物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 12 个赞 · 5 次转发
通过对三个关键基因(G蛋白γ亚基、细胞分裂素氧化酶和理想植物结构1)进行基因编辑,改良了耐盐粳稻品种兰生,提高了产量,同时保持了其原有的耐盐性和品质。
18. 重新定义人类世生物圈的生态系统完整性:基于过程和谱系的恢复框架
斯文宁,J. · 恢复生态学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 17 个赞 · 3 次转发
在人类活动引发的全球变化所塑造的快速转型景观中,生态修复工作日益受到挑战,历史参照状态已不再是可实现甚至理想的目标。然而,生态修复和保护管理仍然依赖于基于组成的生态系统完整性定义,而这些定义假定参照状态稳定。在不断变化的人类主导的生物圈中,此类定义越来越不适用于指导生态修复工作。本文提出一种重新定义生态系统完整性的方法,该方法优先考虑关键生态过程和演化遗产的持续性,而非组成上的一致性。
19. 系统性获得性耐药:茉莉酸酯在局部信号生物合成、转运和远端信号解码中的新兴作用
贝内特,F. 等。 New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 11 个赞 · 5 次转发
近期利用全株植物和共聚焦报告基因成像、电信号传导和单细胞转录组学的研究揭示了特定细胞类型和植物激素网络的时空组织如何参与免疫信号传导。我们结合既有知识总结了这些发现,强调了茉莉酸酯、钙、活性氧和电信号在ETI诱导的系统获得性抗性(SAR)过程中作为早期启动因子、协调因子以及很可能是长距离信号传导的传播因子所发挥的重要作用。
20. 小麦杂种优势:机制、益处和杂交育种面临的挑战
Revell, I. 等人 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 8 个赞 · 6 次转发
本文以小麦为例,详细阐述了目前对杂种优势遗传控制的理解,并探讨了不同F1杂交种生产方法的有效性。我们认为,杂种优势的潜在机制可能是多种或所有现有理论的综合体现,并且利用完整的基因系统可以进一步提高小麦等自交作物向杂交育种系统的转化效率,从而减少对目前较为复杂的杂交生产系统的需求。
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