以下是本周我们调查中分享/点赞/转发次数最多的二十篇科学论文。本周我想起了亨利·庞加莱的一句名言：“科学是由事实构成的，正如房子是由石头建造的；但事实的堆砌并不能称之为科学，正如一堆石头不能称之为房子一样。” 本周分享次数第二多的论文发表于2009年，但看来人们需要被提醒，科学远不止数据。和往常一样，需要付费阅读的论文会用💰标记，否则在我们核查时都可以免费阅读。
这是如何工作的
我们会扫描人们在社交媒体上发布的帖子。 博塔尼汽车 列出并提取包含论文链接的条目。每篇论文被撰写文章提及，即可获得 4 分；转发可获得 3 分；点赞可获得 1 分。
如果用户发布的内容中，植物学相关内容（不一定是论文链接）的占比达到 20% 或以上，我们会尝试将其添加到“植物学自动”版块。我们认为，由于整个列表的用户都对植物感兴趣，因此这类内容更容易脱颖而出。
如果您认为自己应该出现在 Botany Auto 名单上，但却不在，请留言至 @botany.one 在蓝天上。
1. 植物肽激素：三十年的发现与新兴范式
鸟居，堪萨斯大学 · 植物生理学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 60 个赞 · 22 次转发
在这篇综述中，我重点介绍了选定的肽激素家族，包括系统素、PSK、花序脱落缺陷（IDA）/IDA样蛋白、CLAVATA3/胚胎周围区域（CLE）和表皮模式因子（EPF）/EPF样蛋白，并讨论了这些肽及其同源受体的单独发现如何塑造了植物肽信号传导的新兴概念。
鸟居圭子教授 @keikoutorii.bsky.social · on Bluesky
我很荣幸能与大家分享我为百年纪念特刊撰写的、由非人工智能辅助撰写的视角评论文章《植物肽激素：三十年的发现与新兴范式》。
@plantphys.bsky.social 🌱🍅。它是公开的，所以每个人都可以访问！1/
academic.oup.com/plphys/advan...
蓝天视角 →2. 科学理论的终结？
皮格鲁奇，M. EMBO报告 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 52 个赞 · 16 次转发
哲学家路德维希·维特根斯坦（1889-1951）曾说过一句名言：“凡不可言说之事，皆应保持沉默。” 虽然他的这番话是在特定语境下提出的，但实际上，这句至理名言也适用于其他任何事物。克里斯·安德森，《哲学评论》主编，认为这句至理名言同样适用于其他事物。 接线 杂志最好听取这一建议。2008年6月23日，安德森发表了一篇文章，内容是…… Wired杂志 网站上的文章“理论的终结：数据洪流使科学方法过时了”，从中可以清楚地看出，他对科学和科学方法都不太了解。
Bluesky 上讨论过 @bjenquist.bsky.social.
3. 一种基于TurboID的邻近标记方法用于检测植物细胞外蛋白质相互作用
库特布，AM, 希曼斯基，CM, Kettles，GJ · bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 12 次转发
本文设计并验证了一种基于TurboID的PL策略，用于研究本氏烟草叶片细胞间隙中的蛋白质相互作用。该策略利用了致病疫霉诱导子INF1与受体样蛋白（RLP）REL之间在烟草中已充分表征的相互作用。瞬时表达SP-INF1-TurboID（INF1-T）诱导的细胞死亡（CD）反应与天然INF1诱导的反应相当，表明TurboID标签的融合并未影响REL对INF1的识别。
bioRxiv 植物生物学 @biorxiv-plants.bsky.social · on Bluesky
一种基于TurboID的邻近标记方法用于检测植物细胞外蛋白质相互作用 https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.22.753433v1
蓝天视角 →4. 大规模核基因组和质体基因组系统发育分析为更新的被子植物系统发育组分类提供了信息：APG V
Byng，JW 等。 系统学与进化杂志 · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 15 个赞 · 9 次转发
本文对APG分类进行了修订，修订内容考虑了近期对多种被子植物数百个核基因和质体基因的广泛分析。尽管之前的APG分类主要基于单亲遗传标记（质体DNA，通常为母系遗传），但自APG IV以来，已有大量证据表明存在广泛的杂交和祖先多态性的遗传。
英国和爱尔兰植物学会（BSBI） @bsbibotany.bsky.social · on Bluesky
第五版被子植物系统发育组（APG V）分类已经发布。
这是#开放获取，点击这里查看： onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
5. 无脊椎动物和局部环境对沿海拔梯度死亡动植物生物质分解速率的影响
郭，C. 等。 生态专着 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 9 次转发
本文量化了海拔（作为宏观气候的代表）和局部条件（微气候、植被、土壤）如何相互作用，影响不同类型腐生生物的分解速率和无脊椎动物效应。我们在德国阿尔卑斯山脉沿海拔梯度（海拔600-2000米）开展了一项全面的分解实验，实验对象包括五种类型的动植物腐生生物（腐肉、粪便、树叶、山毛榉木和云杉木）。
鲁珀特·塞德尔 @rupertseidl.bsky.social · on Bluesky
不同基质的分解过程是否存在普遍规律？我们通过一项跨海拔实验对此进行了检验，研究对象包括腐肉、粪便、树叶和木材。我们发现分解过程呈现出独特的模式，局部条件比宏观气候更为重要。@sebseibold.bsky.social doi.org/10.1002/ecm....
蓝天视角 →6. 通过关联超显性维持受限重组区域的数量遗传变异
赵宇等 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 17 个赞 · 7 次转发
在这里，我们证明与表现出 AOD 的基因组区域相关的弱选择 QTL 可以将 VA 提升到在没有无条件有害突变的情况下所预期的水平以上。
汤姆·布克 @tombooker.bsky.social · on Bluesky
我很乐意分享这篇预印本。越来越多的证据表明，关联超显性会导致维持性杂合性，我们想知道这会对受稳定选择作用的性状的方差产生怎样的影响：
www.biorxiv.org/content/10.6...
7. 转基因作物推广应用有助于提高产量并适应气候变化下的种植需求 ????
董，CY 等。 自然气候变化 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 16 个赞 · 7 次转发
本文对过去四十年间美国转基因作物推广应用的影响进行了全国范围的空间分析，结果表明转基因作物的推广应用普遍与产量提升相关。研究发现，玉米和大豆的产量更高，产量波动性更低，不利气候因素对产量的影响也部分减弱；而陆地棉受到的影响则较为温和。这表明，转基因作物的发展及其相关因素提高了作物应对气候胁迫的韧性。
PlantEvolution 🌱🌾 @plantevolution.bsky.social · on Bluesky
面对气候变化，传统的转基因作物带来了意想不到的好处：产量波动性降低，气候相关损失减少，甚至减缓了美国玉米和大豆生产向北转移的趋势。
#气候灾难
www.nature.com/articles/s41...
蓝天视角 →8. 两个领域的交汇：玉米植物细胞因子 Zip1 的空间处理
汗，M. · 植物生理学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 13 个赞 · 7 次转发
植物依靠复杂的细胞间通讯来感知环境变化并协调相应的反应。参与这些过程的信号分子包括植物细胞因子，这是一类多样化的植物来源的小肽，能够调节植物的生长、发育和胁迫反应。.
莫里斯·柯尼格 @maukoe.bsky.social · on Bluesky
非常高兴看到我们的 Zip1 研究成果在《植物生理学》杂志上得到重点介绍🌽
跨区室的连续蛋白水解可以决定肽信号发挥作用的位置、时间和形式。
感谢 @mamoonakhan.bsky.social 的精彩点评！
academic.oup.com/plphys/artic...
9. 非编码SNP ELF3 年龄 ELF3β 表达并赋予拟南芥对大陆性气候的适应性
巴克利，CR 等。 植物生理学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 13 个赞 · 6 次转发
植物生物钟控制着决定生长、繁殖和季节性物候的生理和发育过程的时间。因此，生物钟基因的自然变异可以直接影响局部适应，但生物钟中哪些成分已经受到自然选择的影响尚不清楚。我们发现，核心生物钟基因EARLY FLOWERING 3 (ELF3)的自然变异决定了生物钟周期长度，并且在炎热的季节性气候中受到了自然选择。
植物生理学 @plantphys.bsky.social · on Bluesky
ELF3 中的一个非编码 SNP 会改变 ELF3β 的表达，并使拟南芥适应大陆性气候（Christopher R Buckley、Anna Philippova、Alexandre Fournier-Level、Michael J Haydon）。 doi.org/10.1093/plph... #植物科学 @aspbofficial
蓝天视角 →10. 温度介导的花发育变化背后的遗传机制
莱蒂宁，RAE, 埃洛马，P. · 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 12 个赞 · 6 次转发
本综述汇总了目前关于温度对花卉性状影响的研究成果，并探讨了温度介导的花卉发育变化背后的基因和机制。我们重点阐述了性状特异性响应，并探讨了温度介导的性状变异的适应性后果。
实验植物学杂志 @jxbotany.bsky.social · on Bluesky
🌸🌡️达尔文评论🌡️🌸
Laitinen 和 Elomaa 回顾了当前关于温度变化对花卉发育性状的遗传调控及其可塑性的影响，以及这些变化对植物适应性和恢复力的影响的知识。
🔗 doi.org/10.1093/jxb/...
#植物科学🧪
蓝天视角 →11. 生物传感器揭示了幼苗在响应危险信号和病原体感染时，胞质pH值和氧化还原动态的显著差异。
更多的。 等。 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 11 个赞 · 6 次转发
我们利用基因编码生物传感器（GEBs）以时空分辨率监测了拟南芥幼苗整体的胞质pH值和氧化还原动态变化。多种危险信号的全局处理首先诱导根部胞质酸化和氧化，随后是叶柄，最后是下胚轴，揭示了器官特异性响应和双向响应梯度。相比之下，番茄丁香假单胞菌（Pto）DC3000即使在与病原相关分子模式（PAMPs）共同处理的情况下，仍能诱导接种的地上部分胞质持续碱化并抑制氧化还原反应。
12. 单细胞转录组揭示了MADS-box基因在玉米胚珠发育中的分子通路 ????
李，Y. 等。 植物细胞 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 8 个赞 · 7 次转发
在此，单细胞转录组分析表明，ZmMADS8/14 调控胚珠细胞分化，而分支状结构与 mads8;14 突变体中花分生组织终止缺陷和胚珠表皮细胞增殖增强有关。
13. 植物胁迫和发育中的生物分子凝聚体：最新进展和新兴概念
Maruri-López，I. 等。 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 10 个赞 · 6 次转发
在此，我们综合了目前关于凝聚体在植物发育和胁迫反应中的作用的知识，重点关注拟南芥，因为对拟南芥的机制认识最为深入。
14. 红藻结构色下方的多层角质层与后生动物细胞外基质具有共同特征。 ????
Philippe, G. 等。 诉讼中的国家科学院院士 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 9 个赞 · 6 次转发
在此，我们采用整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的方法，并结合碳水化合物分析，来确定红藻多层角质层的组成。 角叉菜 并评估其进化保守性。
15. 生长和细枝减少同时发生，预示着干旱引发的欧洲山毛榉死亡的开始。
施密德，G. 等。 New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 8 个赞 · 6 次转发
严重的反复干旱导致欧洲森林大面积树冠衰退和死亡。干旱引起的死亡是由于结构损伤和生理功能障碍削弱了树木的恢复能力，但目前尚不清楚树木何时会从可逆胁迫转变为整株树木不可逆的活力丧失。我们结合了从地面激光扫描获得的精细枝条结构的详细信息和来自174棵树的径向生长数据，评估了欧洲山毛榉的结构和生长衰退与干旱引起的死亡之间的关系（ 水青冈 ).
16. CERK1介导的腈水解酶磷酸化激活生长素生物合成并促进抗性 灰葡萄孢（Botrytis cinerea） ????
郑杰等 植物细胞 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 12 个赞 · 4 次转发
本研究鉴定出腈水解酶NIT1、NIT2和NIT3是侵染过程中生长素生物合成的关键组分。几丁质被感知后，CERK1与腈水解酶结合并使其磷酸化，从而促进吲哚-3-乙腈（IAN）转化为吲哚-3-乙酸（IAA），进而激活生长素信号通路，增强对灰霉病菌的抗性。
17. LEAFY的结构演化揭示了水生到陆生过渡过程中DNA介导的协同作用和二聚化转变 ????
Verhage, L. 等人 分子植物 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 8 个赞 · 5 次转发
本文结合实验结构测定和生化分析，揭示了LFY二聚化和DNA结合偏好在水生到陆生转变过程中的变化。我们展示了角苔中LFY DNA结合域（DBD）的晶体结构。 神秘角兽 以及藻类 异形插间与 DNA 结合，展现出两种不同的二聚化机制：一种是由直接的蛋白质-蛋白质相互作用介导的，另一种是由 DNA 介导的协同作用驱动的。
18. ZmBBM2-BBIP1-RCC1-4模块增强玉米愈伤组织生长和遗传转化效率
傅，Q. 等。 植物生理学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 7 个赞 · 5 次转发
BABY BOOM (BBM) 编码一种属于 AINTEGUMENTA-LIKE (AIL) 亚家族的 AP2 转录因子，被广泛认为是胚胎发生的关键调控因子。在玉米中，ZmBBM 的异位表达显著提高了多个自交系的遗传转化效率。类似地，另一个玉米 BBM 同源基因 ZmBBM2 的过表达促进了愈伤组织的快速增殖，并显著提高了优良种质的转化效率。
19. 植物特化代谢物的非防御功能：生态现象、分子机制和进化意义
卡莉，LN · New Phytologist · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 7 个赞 · 5 次转发
植物化学研究框架通常假设防御化学物质的进化主要受植食动物的影响。然而，越来越多的证据表明，防御化学物质的变异也会影响许多非防御功能和相互作用。这些相关效应普遍存在，并且可能源于多种潜在的分子机制，包括多效性、共同调控以及相关的历史自然选择。
20. 实现这一目标：利用 PICARD-seq 在 ONT 平台上快速、经济地进行质粒测序
沃尔特斯等人 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 12 个赞 · 3 次转发
质粒构建是分子生物学和合成生物学的基础，然而，验证通常仅限于插入片段而非整个质粒，并且约有三分之一的实验室构建质粒携带可能影响其功能的序列错误。Sanger测序在处理整个质粒时扩展性较差，而短读长测序方法无法解析合成构建体中常见的重复DNA片段，例如启动子。我们提出了一种基于纳米孔的快速测序方案PICARD-seq，该方案使用现成的Tn5快速条形码试剂和MinION测序仪，可在一天内完成整个质粒池的测序。我们还系统地评估了可用于分析所得数据的计算流程。
封面图片： 副白藓 by Stefan Gey / iNaturalist CC BY-NC
