以下是本周Bluesky上分享量最高的论文。这周我读懂的论文相对较少,所以很难用通俗易懂的方式总结这些热门论文。我本可以用Chat-GPT写个轻松的摘要,但我这周读的几篇论文表明,这样做并不明智。其中一篇上榜了,另一篇我稍后会评论。和往常一样,需要付费阅读的论文会用💰标记,否则在我查看时它们都可以免费访问。
这是如何工作的
我们会扫描人们在社交媒体上发布的帖子。 博塔尼汽车 列出并提取包含论文链接的条目。每篇论文被撰写文章提及,即可获得 4 分;转发可获得 3 分;点赞可获得 1 分。
如果用户发布的内容中,植物学相关内容(不一定是论文链接)的占比达到 20% 或以上,我们会尝试将其添加到“植物学自动”版块。我们认为,由于整个列表的用户都对植物感兴趣,因此这类内容更容易脱颖而出。
如果您认为自己应该出现在 Botany Auto 名单上,但却不在,请留言至 @botany.one 在蓝天上。
1. 发育中叶片的逐步氧合作用引导形态发生
Panicucci,G. 等。 科学进展 · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 84 个赞 · 41 次转发
本文研究表明,发育中的叶片会形成时空氧气梯度,这种梯度由氧气感知机制感知。该通路整合局部氧气供应,从而调控叶片形态发生:早期缺氧限制细胞扩张,而随后由远端到近端的氧气供应则会消耗VII组乙烯反应因子,从而促进细胞获得特化命运并控制细胞增殖。
国际植物低氧研究学会 @isplore.bsky.social · on Bluesky
发育中叶片的逐步氧合作用引导形态发生
@daanweits.bsky.social、@panicuccigabriele.bsky.social 和 @syno2xis.bsky.social 的精彩植物科学研究成果现已发表在《科学进展》(Science Advances)杂志上。
www.science.org/doi/10.1126/...
2. 近来在干燥针叶林地带发生的高强度野火是五个世纪以来前所未有的,预示着未来森林损失将更加严重。
美联社记者维恩报道 等。 诉讼中的国家科学院院士 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 55 个赞 · 23 次转发
现代高强度火灾在多大程度上偏离了1900年以前的火灾模式?这些偏离又将如何影响干旱针叶林未来的存续?我们采用多尺度方法来探讨这些问题,该方法结合了北美最大的景观尺度树轮火烧痕网络和新墨西哥州北部杰梅兹山脉的中性景观模型模拟。
Bluesky 上讨论过 @grumpyunclesean.bsky.social.
3. 地球细菌和古菌共生体的基因组目录
Villada,JC 等。 自然·生物技术“ · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 31 个赞 · 17 次转发
本研究利用机器学习(ML)预测了来自不同环境宏基因组样本和参考基因组的十万多个微生物基因组的共生生活方式。预测工作使用symclatron完成,symclatron是一个专门用于识别共生体基因组特征的机器学习框架。
阿克塞尔·维塞尔 @axelvisel.bsky.social · 在 Bluesky
全球微生物共生体目录🌍🦠🧬🫨
来自 @jgi.doe.gov 的新资源,由 @astrogenomics.bsky.social 和 @fmschu.bsky.social 牵头,@emileyeloe-fadrosh.bsky.social、@miferg.bsky.social 等众多人士贡献。
🔓 www.nature.com/articles/s41...
@biosci.lbl.gov @berkeleylab.lbl.gov
4. GPT检测器对非英语母语作家存在偏见
梁 et al. · 模式 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 27 个赞 · 13 次转发
GPT检测器经常将非英语母语者的文章错误地归类为人工智能生成的文章,这引发了人们对其公平性和稳健性的担忧。解决这些检测器中的偏差至关重要,这有助于防止非英语母语者在评估和教育环境中被边缘化,并创建一个更加公平的数字环境。
蒂亚戈·卡瓦略(Thiago Carvalho) @cyrilpedia.bsky.social · on Bluesky
该研究
“GPT检测器对非英语母语写作者存在偏见”
www.cell.com/patterns/ful...
5. 丝状病原体如何将效应蛋白输送到植物细胞中?
Petre, B., Kamoun, S. · 公共科学图书馆生物学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 28 个赞 · 11 次转发
本文探讨了近期引发该领域讨论的一些相互矛盾的研究结果,并重点介绍了基于对寄生虫和宿主在感染过程中的研究而提出的有前景的研究方法。
索菲恩卡蒙 @kamounlab.bsky.social · on Bluesky
植物病理学中的一个重要问题仍然缺乏一个连贯的模型——这是一个糟糕的科学如何使整个领域停滞不前的鲜明例子:
丝状病原体如何将效应蛋白输送到植物细胞中?
dx.doi.org/10.1371/jour...
6. 胚胎来源的肽信号指导胚乳极性
拟南芥 ????
克雷夫,A. 等。 科学 · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 49 个赞 · 22 次转发
被子植物种子的形成需要双受精产物——胚和胚乳——的协调发育。胚乳介导营养物质从周围母体组织向发育中的胚的有效转移。这一功能需要极化的组织结构,表现为早期极性基因表达和极性细胞化动态。我们发现,受体激酶 HAIKU2 (IKU2) 与转录因子 WRKY10/MINISEED3 (MINI3) 协同作用,通过同源域转录因子 WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX 8 (WOX8) 和 WOX9 的活性,确保胚乳极性的稳健建立。
登達也 @tatsuyanobori.bsky.social · on Bluesky
Ingram 和 Zipfel 实验室做得太棒了!祝贺大家!
拟南芥中一种源自胚胎的肽信号指导胚乳极性
www.science.org/doi/10.1126/...
7. 对英国分布情况的评估 沼泽荸荠 亚种 ust (莎草科)利用植物标本馆材料
比德尔,A. 英国和爱尔兰植物学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 32 个赞 · 8 次转发
沼泽荸荠(Eleocharis palustris,又名普通荸荠)存在两个倍性水平,在英国分别以沼泽亚种(subsp. palustris,2n = 16)和沃尔特斯亚种(subsp. waltersii,2n ≈ 38)为代表。尽管该物种分布广泛且被认为保护级别较低,但由于很少有标本被鉴定或确认到亚种水平,人们对低倍性亚种沼泽亚种的分布情况仍然知之甚少。因此,其在英国的现状、生境关联和潜在脆弱性尚不明确。本研究采用一种非破坏性方法,直接从干燥标本中测量气孔大小,并对英国主要植物标本馆的标本进行了检查。结果表明,两个倍性定义的亚种的气孔大小存在显著差异,沼泽亚种较小,沃尔特斯亚种较大,因此可以根据标本进行亚种鉴定。
阿斯特丽德·比德尔博士 @astridbiddle.bsky.social · on Bluesky
很高兴宣布我的新论文:
近两个世纪以来的植物标本馆标本揭示了英国两种倍性定义的沼泽荸荠亚种之间显著的生态和地理差异。
倍性和基因组大小或许可以解释这些现象。 doi.org/10.33928/bib...
8. 植物科学教育宣言
艾尔维,E. 等。 植物、人类、地球 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 22 个赞 · 11 次转发
植物提供氧气、食物、住所、药物和环境服务,没有它们,人类社会将无法生存。应对紧迫的全球性挑战需要训练有素的植物科学家和具备植物意识的民众。本宣言以五个战略重点为核心,提出了一个基于实证的切实可行的植物科学教育强化方案。
Mary Williams @PlantTeaching @plantteaching.bsky.social · on Bluesky
我们仍在完善网站,如果您对植物教育感兴趣,请记下这个日期。
继2025年活动成功举办之后(见) nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/...), 我们计划明年四月在英国剑桥举办“植物教育2”活动。
www.aab.org.uk/event/plant-...
9. 开放生态系统中基于自然的解决方案必须支持生物多样性和人类。 ????
Lehmann,CER 等。 自然地球科学 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 27 个赞 · 9 次转发
在稀树草原和草地上,以自然为基础的解决方案旨在最大限度地增加树木覆盖率和碳吸收,但这可能会破坏生物多样性,造成脆弱的碳储量,并扰乱依赖这些景观的人们的生计,而这一切仅仅是为了获得不确定的气候效益。
詹姆斯·布洛克 @jmbecologist.bsky.social · on Bluesky
在稀树草原和草地中,旨在最大限度提高树木覆盖率和碳吸收量的基于自然的解决方案可能会破坏生物多样性,造成脆弱的碳储量,并扰乱生计。
我们新发表的论文探讨了对树木和森林的痴迷如何破坏了开放的生态系统保护。
www.nature.com/articles/s41...
10. 马铃薯外皮木栓质有助于维持离子稳态和促进生长。 ????
公司-Arumí,D. 等。 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 18 个赞 · 8 次转发
本研究探讨了马铃薯(Solanum tuberosum)根系细胞间隙屏障的形成。我们利用组织化学染色技术,绘制了内皮层和外皮层中木质素/多酚类物质和木栓质的时空沉积图。外皮层首先形成极性的木质素/多酚类物质帽,并在靠近根尖处迅速形成连续的木栓层;而内皮层细胞则首先形成卡氏带,随后不连续地发生木栓化。
实验植物学杂志 @jxbotany.bsky.social · on Bluesky
🥔 研究 🥔
在马铃薯根中,内皮层和外皮层界定了矿质营养的解剖区室。外皮层木栓质早期积累,其减少与离子稳态改变和生长减少有关——Company-Arumí 等人。
🔗 doi.org/10.1093/jxb/...
#植物科学🧪
11. 解码BIG:一种蛋白质如何影响多种通路
佛罗里达州西奥多卢 等。 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 14 个赞 · 9 次转发
正向遗传筛选的一大优势在于其无偏性:植物能够揭示哪些基因控制着特定的生理过程。然而,这一优势也常常带来新的挑战:确定突变表型的生化基础。BIG/DARK 过表达 CAB1/运输抑制剂反应3 编码一种在多种遗传筛选中均被鉴定出的超大蛋白(约0.5 MDa)。big 突变体植株矮小,伸长生长和顶端优势减弱,侧根形成缺陷,这些表型与生长素梯度紊乱相符。然而,它们还表现出气孔行为、昼夜节律调控、病原体反应以及其他激素通路的变化。这种广泛的多效性表明其在信号传导和发育中发挥着重要作用,然而,BIG 的生化功能在三十多年里一直未被阐明。
12. 在同一细胞中,蛋白质组决定细胞状态,而转录组则标记状态转变。
蒂勒特,M. 等。 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 21 个赞 · 6 次转发
在此,我们介绍了一种可扩展的技术,该技术可对同一细胞中的数千种蛋白质和转录本进行定量,通过基于尖端的 C18 捕获将 RNA 与蛋白质分离,并将全长 RNA 测序与最新一代质谱相结合。
13. 后续维护工作:纤维素连接细胞壁构建和蔗糖运输
阿隆索·巴埃斯,L. · 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 7 次转发
本文评论了以下文献:McCubbin TJ, Mertz RA, Baker RF, Leach KA, Barron B, Bhimidine S, Rueda S, Basu A, Chomet P, Wagner R, Grote K, Peevers J, McCann MC, Carpita NC, Slewinski TL, Braun DM. 2026. A maize GT14 family glycosyltransferase affects cell wall composition and carbohydrate export from source leaves. Journal of Experimental Botany 77, 5033–5050. https://doi.org/10.1093/jxb/erag194
14. 一种用于拟合C4气体交换响应曲线的新工具
SMITH et al. · 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 11 个赞 · 7 次转发
本文评论的内容包括: Woodford R、Ermakova M、Furbank RT、von Caemmerer S. 2026. 拟合光合作用二氧化碳和光照响应曲线4 叶片。《实验植物学杂志》 77,4987-4999。 https://doi.org/10.1093/jxb/erag223
15. 屹立不倒:持久性状揭示了植物地下除资源探索和获取之外的其他功能。
Tumber‐Dávila,SJ 等。 New Phytologist · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 11 个赞 · 7 次转发
以往对地下植物性状的研究主要集中于通过根系经济空间(RES)来探讨细根性状之间的权衡关系。然而,这种细根框架仅能反映植物在土壤表面以下所采用的功能策略的一小部分。本文利用新的UNDERPLOT数据集,整合了与根系范围、克隆性和芽库相关的性状,从而拓展了对地下植物功能的认识。
16. 晚二叠世的叶片习性 舌羊齿属来自高古纬度森林的树木
Gulbranson, EL 等人 地质学会学报 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 17 个赞 · 6 次转发
我们通过整合古植物学技术和树木同位素地球化学方法,对最早的极地森林之一(晚二叠世)中的树木进行了研究,结果表明…… c. 260 Ma,南极洲),乔木状舌羊齿类群既有落叶的也有常绿的,在研究的森林中常绿树的数量更多。
17. VRN2-PRC2促进光触发的PIF信号抑制,从而协调拟南芥的生长
奥斯本 et al. · 发育细胞 · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 14 个赞 · 7 次转发
本文研究表明,VRN2在缺氧的茎尖和新生叶片中富集。 拟南芥它通过在促进细胞扩张的关键光敏色素相互作用因子 (PIF) 调控基因中建立稳定且有条件抑制的染色质状态来负调控生长。
18. 噬菌体通讯肽改变 枯草芽孢杆菌 促进菌落发育和孢子形成
Hagbi-Lazar,BE 等。 bioRxiv · Bluesky 发布了 1 篇帖子 · 15 个赞 · 6 次转发
温和型芽孢杆菌噬菌体利用仲裁肽来协调裂解-溶原状态的转变,但成熟的通讯肽是否能被枯草芽孢杆菌直接感知并影响其生理和行为尚不清楚。本文研究表明,φ3T 仲裁肽 SAIRGA 能诱导枯草芽孢杆菌产生序列和立体化学依赖性的响应,这种响应在表面生长的菌落生物膜中强烈表达,但在浮游生长或静态液体膜形态方面则未观察到类似的改变。
19. 植物生物声学:解码超声波发射 ????
Font Bordera, P. 等人 实验植物学杂志 · Bluesky 发布了 3 篇帖子 · 7 个赞 · 6 次转发
几十年来,人们一直认为植物与环境的相互作用主要由化学和视觉刺激介导。然而,最近的研究揭示了植物生理学中一个鲜为人知的维度:空气传播的超声波辐射。本文综述了植物生物声学领域的最新研究进展,重点关注超声波的产生、特征以及在不同胁迫条件下的特异性。
20. 水杨酸触发的质外体蛋白水解释放出具有独特免疫原功能的隐蔽植物细胞因子
Katzy, P. 等人 bioRxiv · Bluesky 发布了 2 篇帖子 · 11 个赞 · 6 次转发
本文研究表明,水杨酸(SA)通过胞外丝氨酸水解酶驱动的早期瞬时蛋白水解程序,快速重塑玉米胞外肽组。时间序列肽组学分析鉴定出14种候选植物细胞因子,其中包括两种隐蔽肽PC13和PC14,它们分别由应激相关锌指蛋白ZmSAP7和迁移抑制因子样蛋白ZmMDL1释放。
封面图片: 拟南芥(Arabidopsis thaliana) by 沃尔夫冈·尧赫 CC BY