图片:Gerhard Schuster,维基共享资源。
细胞、基因和分子

木材驱逐舰测序

木材降解真菌裂褶菌(Schizophyllum commune)的基因组已被测序,为了解真菌生物学和潜在的工业应用提供了依据。

https://www.botany.one/wood-destroyer-sequenced/

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在优美低调的开场白中——配得上沃森和克里克 1953 年描述 DNA 结构的著名开创性论文——Robin Ohmi et al. (自然·生物技术“,doi:10.1038/nbt.1643) 提醒我们,“关于形成蘑菇的真菌的生物学还有很多有待了解,它们是食物、次级代谢产物和工业酶的重要来源”。

作为病原体和菌根,这些生物有时也分别是植物的祸害和救命伙伴。 好消息是,现在已经对一种食草动物的基因组进行了测序。

希望对 13,210 个基因进行分析 裂褶菌的 38.5 兆碱基基因组将导致使用这种“用于研究蘑菇发育的遗传易处理模型”更好地了解伞菌生物学。 此外 - 并从真菌的木材吞噬活动中获得好处 - 揭示这种能力可能有助于我们开发更有效的木材降解过程以及伴随的工业应用。

我们通过另外两个与植物相关的基因组序列(小麦和苹果)的新闻继续 DNA 主题。 一个英国团队最近制作了一份面包小麦的基因组草图(普通小麦) 种类 '中国春天',它已在以下位置免费提供 http://www.cerealsdb.uk.net/.

尽管公认的只是迈向完全注释基因组的第一步,但小麦是世界主要粮食作物之一,这一里程碑被视为对支持全球粮食安全的努力的重大贡献。 结果绝非易事,因为六倍体小麦基因组的大小是人类基因组的五倍,而且谷物的进化历史非常复杂,涉及大量来自祖先禾本科植物的遗传物质。

与此同时,在大西洋的另一边(但发表在英国期刊上),另一个小组已经制作了“驯化苹果的高质量基因组序列草图(马鲁斯 × 家蝇)'(“自然遗传学,doi:10.1038/ng.654). 对“Golden Delicious”品种的基因组进行测序的任务——大约在750 兆碱基,估计包含 57,386 个基因,甚至比小麦的还要大——Riccardo Velasco 和 >80 名同事花了 2 年时间。

尽管苹果不是与小麦同属一类的主食,但作为蔷薇科的木本成员,包括许多重要的水果作物,解开其遗传秘密将对进一步开发这些作物极为有用,并构成重要的补充不断增长的植物基因组序列列表。

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作者

Nigel Chaffey

我是一名植物学家,也是巴斯温泉大学(巴斯,靠近英国布里斯托尔)植物学的前高级讲师。 作为新闻编辑 Annals of Botany 我为该杂志撰写了每月一次的“植物扦插”专栏。

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